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Text File  |  1995-03-04  |  1.6 KB  |  33 lines
  1. *****************************************************************
  2. * 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase signature *
  3. *****************************************************************
  4.  
  5. All organisms require reduced folate cofactors  for the synthesis of a variety
  6. of metabolites.  Most  microorganisms  must synthesize folate  de novo because
  7. they lack the  active transport system of higher vertebrate cells which allows
  8. these organisms   to   use   dietary   folates.  Enzymes  involved  in  folate
  9. biosynthesis are therefore targets for a variety of antimicrobial agents  such
  10. as trimethoprim or sulfonamides.
  11.  
  12. 7,8-dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase     (EC 2.7.6.3)    (HPPK)
  13. catalyzes the attachment of pyrophosphate to 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropterin
  14. to form 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropteridine pyrophosphate.  This is the first
  15. step in a three-step pathway leading to 7,8-dihydrofolate.
  16.  
  17. Bacterial HPPK (gene folK or sulD) [1] is a  protein  of      160 to 270 amino
  18. acids. In the lower eukaryote Pneumocystis carinii, HPPK is the central domain
  19. of a multifunctional folate synthesis enzyme (gene fas) [2].
  20.  
  21. As a signature for HPPK, we selected a conserved region located in the central
  22. section of these enzymes.
  23.  
  24. -Consensus pattern: G-P-R-x(2)-D-L-D-[LIVM](2)
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: December 1992 / First entry.
  28.  
  29. [ 1] Talarico T.L., Ray P.H., Dev I.K., Merrill B.M., Dallas W.S.
  30.      J. Bacteriol. 174:5971-5977(1992).
  31. [ 2] Volpes F., Dyer M., Scaife J.G., Darby G., Stammers D.K., Delves C.J.
  32.      Gene 112:213-218(1992).
  33.